1936 m. automobilių kompanija užsitarnavo lyderio poziciją tarp vietinių automobilių gamintojų ir sulaukė teigiamų atsiliepimų iš kitų šalių. Atėjus Antrajam pasauliniam karui ir okupacijai, gamyba orientuota į Vokietijos poreikius. Gamykla bombarduojama artėjant karo pabaigai.
Škoda užėmė antrąją vietą Monte Karlo ralyje su „Popular Sport“ modeliu, vėliau žinomu Monte Carlo pavadinimu. „Popular“ ir toliau laimėjo lenktynes Afrikoje, Balkanuose ir Urugvajuje. Modelių asortimentas buvo plečiamas įtraukiant vidutinio dydžio modelį Škoda Favorit.
Pristatytas Škoda „Popular 995“. Ši „Škoda žmonėms“ (čekiškai „Škoda pro dang“) vadinta „Liduška“ – mergaitės vardu, reiškiančiu „lidový“ („žmonės“). Prasidėjus Antrajam pasauliniam karui civilinių automobilių gamyba nutrūko. Visą įmonių grupę kontroliavo Reichswerke Hermann Göring AG.
Automobilių pramonė keitė specializaciją ir perėjo prie karinės įrangos gamybos. Be ginklų komponentų, daugiausia gaminti įvairių tipų pristatymo vežimėliai, visais ratais varomos transporto priemonės ir RSO sunkusis traktorius.
Pirmieji modernizuoti Škoda Popular automobiliai paliko smarkiai apgadintą Mladá Boleslav gamyklą. Valstybės ekonomiką kontroliavo socialistinis režimas – 1945 m. pavasarį buvo nacionalizuojamos didelės įmonės, įskaitant Škoda gamyklas Pilzene ir ASAP Mladá Boleslav mieste.